茯苓與茯神均為多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，但茯苓使用菌核整體，茯神僅選用帶有松根的部分，二者在藥用部位和功效側(cè)重上存在差異。
1、藥用部位差異
茯苓為完整菌核切制而成，包含白色茯苓塊和赤色茯苓皮；茯神需選取菌核中包裹松樹(shù)根的部分，橫切面可見(jiàn)松木紋理。這種差異導(dǎo)致茯神質(zhì)地較茯苓更疏松，吸水性更強(qiáng)。
2、功效側(cè)重不同
茯苓長(zhǎng)于利水滲濕，主治水腫尿少、痰飲眩悸；茯神因含松根成分，寧心安神效果更突出，適用于失眠驚悸、健忘多夢(mèng)。二者均歸心脾經(jīng)，但茯神對(duì)心神的調(diào)節(jié)更具針對(duì)性。
3、化學(xué)成分區(qū)別
茯苓主要含β-茯苓聚糖和三萜類(lèi)物質(zhì)；茯神除上述成分外，還含有松根特有的揮發(fā)油及樹(shù)脂類(lèi)成分，這些物質(zhì)可能通過(guò)血腦屏障發(fā)揮鎮(zhèn)靜作用。
4、臨床應(yīng)用差異
茯苓多配伍豬苓、澤瀉用于五苓散等利水方劑；茯神常與酸棗仁、遠(yuǎn)志組成安神湯劑?，F(xiàn)代研究發(fā)現(xiàn)茯神提取物對(duì)γ-氨基丁酸受體有調(diào)節(jié)作用。
5、炮制方法區(qū)別
茯苓可切塊、切片或磨粉；茯神需保留松根部分特殊處理，傳統(tǒng)要求松根直徑需達(dá)3毫米以上，現(xiàn)代研究證實(shí)松根有效成分與安神效果正相關(guān)。
使用茯苓或茯神時(shí)應(yīng)注意體質(zhì)差異，脾虛濕盛者宜選茯苓，心脾兩虛失眠者更適合茯神。二者均需避免與辛辣刺激食物同服，煎煮時(shí)茯神因含松脂成分更易糊鍋，建議用紗布包裹后入藥。日常食療中，茯苓可配伍薏米煮粥，茯神適合與龍眼肉同燉，但連續(xù)服用不宜超過(guò)兩周，出現(xiàn)食欲減退或腹瀉時(shí)應(yīng)停用。孕婦及陰虛津虧者須在中醫(yī)師指導(dǎo)下使用，不可自行長(zhǎng)期大量服用。