檸檬水適合在晨起空腹、餐后1小時、運動后及睡前1小時飲用，具體時間需結合個人體質和需求調整。
晨起空腹飲用檸檬水有助于促進胃腸蠕動，幫助清除宿便，但胃酸過多者應避免。溫水沖泡的檸檬水能減少對胃黏膜的刺激，建議搭配少量蜂蜜調節(jié)口感。餐后1小時飲用可輔助消化，檸檬中的有機酸能促進胃液分泌，但胃炎患者需謹慎。運動后補充檸檬水能快速恢復電解質平衡，其含有的鉀離子可預防肌肉痙攣，建議與淡鹽水交替飲用。睡前1小時少量飲用檸檬水有助于放松神經，但需注意口腔清潔以防齲齒風險。
日常飲用檸檬水建議使用新鮮檸檬切片，水溫控制在60℃以下以保留維生素C，每日總量不超過1000毫升。避免與牛奶、海鮮同食以防蛋白質變性或消化不良，糖尿病患者飲用時無須添加糖分。長期飲用者需定期檢查牙釉質狀況，胃腸功能較弱者可改用吸管減少酸性物質接觸牙齒。出現(xiàn)反酸或腹痛時應暫停飲用并咨詢醫(yī)生。