乙肝病毒難以完全清除主要與病毒復(fù)制特性、免疫逃逸機制及肝細胞整合有關(guān)。慢性乙肝病毒感染可能發(fā)展為肝硬化或肝癌，需長期規(guī)范治療和監(jiān)測。
乙肝病毒進入肝細胞后會形成共價閉合環(huán)狀DNA，這種DNA在細胞核內(nèi)非常穩(wěn)定，可長期存在并作為病毒復(fù)制的模板?，F(xiàn)有抗病毒藥物如恩替卡韋片、富馬酸替諾福韋二吡呋酯片等能抑制病毒復(fù)制，但無法徹底清除cccDNA。病毒還可能通過變異逃避免疫識別，例如前C區(qū)變異導(dǎo)致HBeAg陰性但病毒仍活躍復(fù)制。部分患者的病毒DNA會整合到宿主基因組中，與肝細胞增殖同步復(fù)制。免疫系統(tǒng)對乙肝病毒的特異性免疫應(yīng)答不足也是重要原因，尤其嬰幼兒期感染更易慢性化。
極少數(shù)急性感染者可通過強烈免疫反應(yīng)清除病毒，但多數(shù)慢性感染者肝臟內(nèi)持續(xù)存在低水平病毒復(fù)制。合并HIV感染或免疫抑制治療可能重新激活病毒復(fù)制。隱匿性乙肝感染表現(xiàn)為血清學(xué)檢測陰性但肝組織仍存在病毒，這類患者接受化療或免疫抑制劑時有乙肝再活動風(fēng)險。
乙肝病毒攜帶者應(yīng)每3-6個月檢測肝功能、乙肝兩對半和HBV-DNA，避免飲酒和肝毒性藥物。適量攝入優(yōu)質(zhì)蛋白如魚肉豆制品，配合維生素豐富的蔬菜水果有助于維持肝功能。規(guī)律作息和適度運動可增強免疫力，接種甲肝疫苗可預(yù)防重疊感染。出現(xiàn)乏力、黃疸等癥狀時需及時就醫(yī)，妊娠期女性應(yīng)進行乙肝病毒母嬰阻斷。核苷類似物治療期間不可擅自停藥，需在醫(yī)生指導(dǎo)下調(diào)整方案。