鐵蒿的副作用可能包括胃腸不適、過敏反應等，禁忌人群主要為孕婦、過敏體質者及肝腎功能不全者。鐵蒿作為中藥材，使用需嚴格遵醫(yī)囑，避免自行濫用。
鐵蒿含有揮發(fā)油及多種活性成分，部分人群服用后可能出現(xiàn)惡心、腹脹等胃腸刺激癥狀，多與空腹服用或過量使用有關。過敏體質者接觸后可能誘發(fā)皮膚瘙癢、紅斑等反應，嚴重時可能出現(xiàn)呼吸道水腫。長期大劑量使用可能對肝臟代謝功能產生負擔，尤其肝功能異常者風險更高。鐵蒿中的某些成分可能刺激子宮平滑肌收縮，孕婦禁用以防流產風險。哺乳期女性及兒童也應在醫(yī)師指導下謹慎使用。
使用鐵蒿期間應避免與鎮(zhèn)靜類藥物同服，可能增強中樞抑制作用。傳統(tǒng)認為其性味苦寒，脾胃虛寒者長期服用可能加重腹瀉、畏寒等癥狀。新鮮鐵蒿外敷可能引起接觸性皮炎，建議先進行小范圍皮膚測試。部分文獻提示其可能影響抗凝血藥物療效，需監(jiān)測凝血功能。中藥配伍中不宜與溫熱性質藥材如附子等同用，可能降低藥效或產生不良反應。
建議使用鐵蒿前咨詢中醫(yī)師辨證施治，出現(xiàn)不良反應立即停用。日常儲存需置于陰涼干燥處，防止霉變。服藥期間忌食生冷油膩，保持規(guī)律作息有助于藥物吸收代謝。若需長期服用，應定期復查肝腎功能及血常規(guī)。