鼠尾草在常規(guī)使用下較為安全，但部分人群可能出現(xiàn)胃腸不適或神經(jīng)系統(tǒng)反應(yīng)，禁忌包括孕婦、癲癇患者及肝腎功能不全者。
鼠尾草含有揮發(fā)油與萜類化合物，過量食用可能刺激胃腸黏膜，引發(fā)惡心或腹部隱痛，長期大劑量使用可能影響中樞神經(jīng)系統(tǒng)，導(dǎo)致頭暈或輕微震顫。其活性成分可通過胎盤屏障，孕婦使用可能干擾胎兒發(fā)育，哺乳期女性亦須謹慎，避免成分經(jīng)乳汁影響嬰兒。癲癇患者對其中樟腦等成分敏感，可能誘發(fā)神經(jīng)元異常放電，肝腎功能不全者代謝能力下降，易造成成分蓄積。
鼠尾草與抗凝藥物如華法林鈉片合用可能增強出血風(fēng)險，與降糖藥如鹽酸二甲雙胍片聯(lián)用或加劇血糖波動，手術(shù)前兩周需停用以避免術(shù)中出血。兒童青少年神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育未完善，使用可能引起注意力渙散或睡眠紊亂，過敏體質(zhì)者接觸后可能出現(xiàn)皮疹或呼吸道水腫。
使用鼠尾草需控制單次劑量與持續(xù)時間，出現(xiàn)不良反應(yīng)應(yīng)立即停用并清理殘留成分，日常存儲需避光防潮以保持穩(wěn)定性，烹飪或藥用時優(yōu)先選擇標準化提取物，避免與酒精飲料同服。若需長期應(yīng)用，建議通過血清檢測評估肝酶指標，并定期觀察皮膚黏膜變化，中草藥制劑須標注產(chǎn)地與采收季節(jié)，不同炮制方法可能改變其化學(xué)性質(zhì)與生物利用度。