藍花扁竹具有清熱解毒、消腫止痛等藥用價值，常用于治療咽喉腫痛、跌打損傷等癥狀。藍花扁竹的藥用部分主要為根莖，含有黃酮類、生物堿等活性成分，其應用需遵醫(yī)囑。
1、清熱解毒
藍花扁竹的根莖提取物對金黃色葡萄球菌、鏈球菌等常見致病菌有抑制作用，可用于緩解風熱感冒引起的咽喉腫痛。臨床多與其他清熱解毒藥材配伍使用，如金銀花、連翹等。外用時可搗碎敷于患處，但皮膚破損者慎用。
2、消腫止痛
藍花扁竹中的生物堿成分能抑制炎癥介質釋放，對跌打損傷導致的局部紅腫疼痛有一定緩解作用。民間常將新鮮根莖搗爛后外敷，配合活血化瘀類藥物可增強效果。需注意開放性傷口禁止直接外敷，避免感染風險。
3、利尿通淋
藍花扁竹煎劑能促進尿液生成，對濕熱下注引起的小便不利、尿路澀痛有輔助改善作用。常與車前草、瞿麥等利尿通淋藥材配伍使用。腎功能不全者應避免長期大量服用，可能加重腎臟負擔。
4、抗炎抑菌
實驗研究表明，藍花扁竹乙醇提取物對大腸桿菌、白色念珠菌等微生物具有抑制效果，其黃酮類成分可通過調節(jié)免疫反應減輕炎癥。臨床多用于濕熱型腸炎、陰道炎的輔助治療，但需配伍其他抗感染藥物。
5、調節(jié)免疫
藍花扁竹多糖成分能激活巨噬細胞功能，增強機體非特異性免疫力。動物實驗顯示其可提高環(huán)磷酰胺模型小鼠的胸腺指數，但具體作用機制仍需進一步研究。體質虛弱者使用前應咨詢中醫(yī)師辨證施治。
使用藍花扁竹時需注意，其性偏寒涼，脾胃虛寒者慎用；孕婦及過敏體質者禁用。建議在中醫(yī)師指導下配伍使用，避免單味藥長期服用。新鮮根莖外敷前需清潔處理，出現皮膚瘙癢等過敏反應應立即停用。日常可曬干后密封保存于陰涼處，防止霉變影響藥效。