基孔肯雅熱病毒基因組為單股正鏈RNA，全長(zhǎng)約11.8kb，包含5'非編碼區(qū)、結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)和非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)三部分。
基孔肯雅熱病毒屬于披膜病毒科甲病毒屬，其基因組RNA具有感染性。5'端帶有甲基化帽結(jié)構(gòu)，3'端有多聚腺苷酸尾，兩端非編碼區(qū)對(duì)病毒復(fù)制起調(diào)控作用。結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)依次編碼衣殼蛋白C、包膜糖蛋白E3-E2-6K-E1，其中E1和E2糖蛋白構(gòu)成病毒表面刺突，介導(dǎo)細(xì)胞受體結(jié)合和膜融合。非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)產(chǎn)生nsP1至nsP4四種蛋白，共同組成RNA依賴的RNA聚合酶復(fù)合體，負(fù)責(zé)病毒基因組復(fù)制和亞基因組RNA轉(zhuǎn)錄。病毒顆粒呈球形，直徑約70nm，核衣殼為二十面體對(duì)稱結(jié)構(gòu)，外層包膜鑲嵌有糖蛋白二聚體。
了解病毒基因組結(jié)構(gòu)有助于研發(fā)特異性診斷試劑和靶向治療藥物。出現(xiàn)發(fā)熱、關(guān)節(jié)痛等疑似癥狀時(shí)應(yīng)及時(shí)就醫(yī)，避免蚊蟲叮咬是重要的預(yù)防措施，注意清除積水容器等蚊蟲滋生環(huán)境，在流行區(qū)活動(dòng)時(shí)可使用驅(qū)蚊劑并穿著長(zhǎng)袖衣物。