沖牙器不能完全代替牙刷，兩者在口腔清潔中各有側重功能。

沖牙器通過高壓水流能有效清除牙縫、牙齦線下的食物殘渣和部分菌斑，尤其適合牙周病患者、正畸人群或種植牙使用者。但其水流難以徹底清除牙齒表面黏附的菌斑生物膜，而牙刷通過機械摩擦可破壞這種生物膜結構。沖牙器對牙菌斑的清除率約為50%，而牙刷配合巴氏刷牙法可達70%以上。臨床研究顯示，單純使用沖牙器的人群牙菌斑指數(shù)顯著高于牙刷使用者。

牙刷的物理刷毛能深入牙齦溝1-2毫米進行清潔，這是沖牙器水流難以精準覆蓋的區(qū)域。對于牙結石預防、牙齒鄰面清潔以及咬合面窩溝清潔，牙刷仍具有不可替代性。沖牙器更適合作為輔助工具，在刷牙后使用可進一步提升清潔效果約30%。特殊情況下如口腔術后暫時無法刷牙時，沖牙器可短期替代，但需配合抗菌漱口水使用。

建議將沖牙器作為口腔清潔的補充工具，與牙刷配合使用效果更佳。每日至少刷牙兩次，每次不少于兩分鐘，重點清潔牙齦緣和牙齒鄰面。使用沖牙器時可選擇脈沖模式，水溫保持在30-40℃避免刺激，從后牙區(qū)開始緩慢移動噴頭，每顆牙停留3-5秒。正畸患者需選用專用正畸噴頭，種植牙使用者應避免直接沖擊種植體頸部。定期更換沖牙器噴頭，每3-6個月更換牙刷，并每年進行專業(yè)潔牙和口腔檢查。注意觀察牙齦出血情況，持續(xù)出血需及時就醫(yī)排查牙周疾病。